Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTBN1Q01082 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms