Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1BQ00975 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms