Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD1P98174 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD1P98174 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD1P98174 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD1P98174 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD1P98174 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD1P98174 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms