Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TMF1P82094 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMF1P82094 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMF1P82094 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMF1P82094 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMF1P82094 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TMF1P82094 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMF1P82094 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMF1P82094 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMF1P82094 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMF1P82094 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMF1P82094 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMF1P82094 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMF1P82094 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMF1P82094 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMF1P82094 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms