Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL8P80075 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL8P80075 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL8P80075 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL8P80075 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL8P80075 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL8P80075 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms