Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT85P78386 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT85P78386 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT85P78386 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT85P78386 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT85P78386 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT85P78386 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT85P78386 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms