Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO1P63165 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms