Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms