Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P62684 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms