Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPD3P62318 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms