Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARF3P61204 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARF3P61204 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARF3P61204 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARF3P61204 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARF3P61204 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARF3P61204 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARF3P61204 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARF3P61204 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARF3P61204 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARF3P61204 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARF3P61204 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms