Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTBP60709 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTBP60709 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTBP60709 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTBP60709 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTBP60709 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms