Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN2P57739 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms