Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP9P55211 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP9P55211 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms