Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP7P55210 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASP7P55210 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASP7P55210 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP7P55210 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP7P55210 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP7P55210 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP7P55210 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP7P55210 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms