Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRLP54845 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRLP54845 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRLP54845 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRLP54845 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NRLP54845 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRLP54845 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRLP54845 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRLP54845 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRLP54845 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRLP54845 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms