Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA4P51532 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms