Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETV1P50549 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETV1P50549 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETV1P50549 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETV1P50549 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms