Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX2P50458 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX2P50458 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX2P50458 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX2P50458 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX2P50458 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX2P50458 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX2P50458 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX2P50458 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX2P50458 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms