Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC2P49815 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC2P49815 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC2P49815 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC2P49815 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC2P49815 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC2P49815 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC2P49815 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC2P49815 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC2P49815 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC2P49815 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC2P49815 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms