Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPFP49454 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPFP49454 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPFP49454 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPFP49454 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPFP49454 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPFP49454 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPFP49454 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms