Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms