Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PXNP49023 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PXNP49023 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXNP49023 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXNP49023 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXNP49023 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXNP49023 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXNP49023 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PXNP49023 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXNP49023 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms