Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms