Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX1P48742 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX1P48742 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX1P48742 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX1P48742 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX1P48742 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms