Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NESP48681 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NESP48681 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
NESP48681 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NESP48681 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NESP48681 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NESP48681 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NESP48681 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NESP48681 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NESP48681 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NESP48681 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NESP48681 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NESP48681 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NESP48681 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NESP48681 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NESP48681 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NESP48681 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
NESP48681 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NESP48681 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
NESP48681 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NESP48681 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NESP48681 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NESP48681 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NESP48681 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NESP48681 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NESP48681 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NESP48681 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NESP48681 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NESP48681 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NESP48681 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NESP48681 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NESP48681 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms