Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ1P48048 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ1P48048 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNJ1P48048 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNJ1P48048 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNJ1P48048 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms