Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR1P43307 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR1P43307 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR1P43307 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR1P43307 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR1P43307 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR1P43307 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR1P43307 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR1P43307 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR1P43307 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR1P43307 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR1P43307 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSR1P43307 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR1P43307 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms