Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPD2P43304 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms