Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GARSP41250 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARSP41250 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARSP41250 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARSP41250 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARSP41250 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARSP41250 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARSP41250 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARSP41250 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GARSP41250 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARSP41250 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARSP41250 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms