Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms