Protein–RNA interactions for Protein: P40227

CCT6A, T-complex protein 1 subunit zeta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT6AP40227 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT6AP40227 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT6AP40227 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms