Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDXP35241 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDXP35241 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDXP35241 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDXP35241 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDXP35241 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDXP35241 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDXP35241 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDXP35241 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms