Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSPA4P34932 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms