Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIITAP33076 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIITAP33076 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIITAP33076 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIITAP33076 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIITAP33076 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIITAP33076 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIITAP33076 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIITAP33076 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIITAP33076 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIITAP33076 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIITAP33076 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIITAP33076 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms