Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms