Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLIP1P30622 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms