Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINB3P29508 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINB3P29508 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINB3P29508 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINB3P29508 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINB3P29508 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINB3P29508 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms