Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTGFP29279 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTGFP29279 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTGFP29279 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTGFP29279 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTGFP29279 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTGFP29279 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTGFP29279 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTGFP29279 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms