Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCAP28676 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCAP28676 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCAP28676 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCAP28676 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCAP28676 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCAP28676 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCAP28676 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCAP28676 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms