Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR2P28476 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR2P28476 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms