Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNTFRP26992 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms