Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA2P26232 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms