Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSSP25774 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSSP25774 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTSSP25774 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTSSP25774 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTSSP25774 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTSSP25774 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTSSP25774 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTSSP25774 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms