Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2P22307 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCP2P22307 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCP2P22307 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCP2P22307 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCP2P22307 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCP2P22307 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2P22307 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2P22307 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2P22307 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2P22307 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCP2P22307 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCP2P22307 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCP2P22307 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms