Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRHP20396 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRHP20396 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRHP20396 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRHP20396 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRHP20396 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRHP20396 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRHP20396 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRHP20396 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRHP20396 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRHP20396 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRHP20396 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRHP20396 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRHP20396 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRHP20396 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRHP20396 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRHP20396 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRHP20396 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRHP20396 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRHP20396 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TRHP20396 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRHP20396 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRHP20396 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRHP20396 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRHP20396 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms