Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNI3P19429 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms