Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms