Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms