Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DESP17661 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DESP17661 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DESP17661 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DESP17661 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DESP17661 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DESP17661 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DESP17661 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms